Trois orientations sont possibles en M2 :

-     Professionnel, pour une insertion directe dans la vie active,

-     Recherche, en vue d'une poursuite d'études en doctorat (Bac+8),

-    Recherche et Professionnel, lorsque les deux orientations sont possibles au sein de la même spécialité.

Suite à la réforme intervenue en 2009 sur les modalités de recrutement des enseignants, l'UPS a mis en place des masters spécifiques. En plus d'offrir une solide formation disciplinaire et une préparation adaptée aux concours, ces masters «Pro Enseignement» donnent aux étudiants une formation professionnelle aux métiers de l'enseignement (UE de didactique de la discipline, stages en établissement ...). Pour chacun d'eux, une formation non diplômante est associée au M2. Elle s'adresse aux étudiants qui ont validé le master « enseignement » et échoué au concours lors de la 1ère tentative, et aux étudiants titulaires d'un autre M2 afin de préparer les concours. L'inscription à la formation non diplômante est limitée à un an et non renouvelable.

L'UPS propose 98 spécialités de master réparties en 3 domaines et 21 mentions.