L'objectif de la mention SDM est de former des cadres supérieurs en gestion ayant des compétences intégrées en management des systèmes de production, des systèmes d'information et des systèmes de gestion ainsi qu'en  anglais. Ces cadres seront capables de résoudre des problèmes de gestion transversaux caractéristiques des organisations de plus en plus complexes. Cette formation au management transversal concerne aussi bien des étudiants en gestion que des étudiants issus de filières scientifiques et techniques à la recherche d'une double compétence. Elle leur apporte des connaissances sur l'ingénierie de projet et sur la maîtrise des aspects fondamentaux du management des organisations.
La formation du Master 1 est axée sur le pilotage des organisations (vision transversale de l'organisation, objectifs de polyvalence et multicompétence des acteurs).
Objectifs communs aux 2 spécialités de master professionnel : former des généralistes du pilotage organisationnel capables d'expertise dans le management de projets de développement ou projets d'optimisation pour servir des cibles variées (entreprises en réseau ou petites et moyennes organisations, entreprises existantes ou en gestation, de stature locale ou internationale).

Les deux spécialités de Master 2 partagent cette vision transversale du management de l'organisation. La première (Ingénierie des Organisations) offre 2 parcours : management de l'entreprise en réseau (Toulouse) et entrepreneuriat et management des petites et moyennes organisations (Tarbes). La seconde (Management International du Transport Aérien et du Tourisme) mobilise cette démarche dans un secteur spécifique et dans un contexte international en privilégiant une entrée dans les questions managériales par l'outil linguistique.