L'université accompagne et conseille les porteurs de projets sur les sources de financement en fonction des caractéristiques du projet à développer, apporte une aide au montage des projets, manage et gère les projets en coordination.

À l'université, les chargés de projets disposent d'une expertise dans les programmes de coopération territoriale européenne soutenus par les fonds FEDER, principalement INTERREG (Poctefa, SUDOE, MED, Interreg Europe), dans les programmes sectoriels (Erasmus+, Jean Monnet et Horizon Europe) ou dans diverses initiatives intergouvernementales.